Narodowe Archiwum Cyfrowe, na podstawie art. 28 ust. 1 pkt 3 ustawy z dnia 14 lipca 1983 r. o narodowym zasobie archiwalnym i archiwach (Dz. U. z 2019 r., poz. 553 z późn. zm.), przeprowadza kontrole postępowania z materiałami archiwalnymi wchodzącymi do państwowego zasobu archiwalnego i dokumentacją niearchiwalną powstałą i zgromadzoną w organach i jednostkach organizacyjnych, będących we właściwości NAC, bez względu na miejsce i tytuł prawny przechowywania tych materiałów lub dokumentacji. Nie sporządza się odrębnego planu kontroli NAC. Informacje o planowanych kontrolach zawarte są w planie pracy NAC. Ogólne informacje o przeprowadzonych kontrolach zawarte są w sprawozdaniach rocznych NAC.